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儿童保健所成立于1987年10月,是以降低全市儿童死亡率,提高出生人口素质为目标,以预防为主、防治结合为服务宗旨的保健机构,是全市儿童保健三级网络的业务管理和指导单位.负责全市儿童保健业务管理、队伍建设和人员培训等工作.担负全市儿童体格及神经精神、心理发育监测、五官保健等的指导工作,同时负责全市托幼机构卫生保健业务指导工作,对各级儿保医师进行业务培训及考核,负责对托幼机构保育员、保健员培训和技术等级鉴定工作.并开设各种具有儿童保健特色的门诊,如营养性疾病的咨询和诊治(贫血、佝偻病、营养不良、肥胖病、生长迟缓等疾病);神经精神发育异常、智力低下、学习困难、感觉统合失调、心理保健咨询;儿童口腔保健和矫治、儿童眼保健、弱视筛查和诊治以及听力测试和神经精神发育评估等.制定全市0-6岁儿童保健管理规范和操作常规.
儿童保健所为了适应儿童保健事业发展的需要,近年来先后开展了病残儿童鉴定、新生儿遗传代谢性疾病和听力筛查、出生缺陷管理、5岁以下儿童死亡监测和评审的管理及全市危重新生儿会诊抢救中心的管理工作.负责收集、分析全市儿童保健工作各种指标并定期向卫生部、市卫生局上报等信息管理工作.承担和开展多项科研课题,并进行应用性研究,为政府制定政策提供依据.为普及科学育儿知识,提高队伍业务水平,制作宣传版面、编写科普书籍、摄制录像等宣传资料,为各级儿童保健机构及婴幼儿家长提供宣教服务.上海市儿童保健所在011年荣获上海市第八届“儿童工作白玉兰奖”.